El colegio Champagnat cuenta con dos secciones de educación: básica y media.

La sección de Educación Básica va desde prekinder a sexto básico y la sección de educación media considera los cursos de séptimo a cuarto medio. Ambas secciones están separadas por un edificio que reúne a las salas de séptimos y octavos básicos y cuentan con patios y multicanchas. Cada sección cuenta con un Director Académico, quien ejerce las funciones de liderazgo y coordinación de los estamentos bajo sus cargo y quien se reúne periódicamente con los docentes de cada nivel para revisar los lineamientos colegiales y de la Provincia marista.

Cada sección cuenta además con un equipo multidisciplinario de apoyo entre los que destacan el Coordinador Pedagógico, los inspectores y un equipo de profesionales sicólogos, orientadores y educadores diferenciales que apoyan la labor docente. Además, en la sección de educación Media se cuenta con un Coordinador de Terceros y Cuartos Medios que atiende las problemáticas del Plan Diferenciado y de los resultados de la Prueba de Selección Universitaria.

Director Seccion E. Media: Sr. Emilio Moltedo C.
Director Sección E. Básica: Sr. Hernán Urzúa V.